Misją Fundacji jest szeroko rozumiany rozwój innowacji w Polsce, w tym upowszechnianie nowoczesnych technologii, pomoc w rozwoju społeczeństwa informatycznego oraz budowanie współpracy międzynarodowej na rzecz rozwoju nauki i gospodarki.

Celami statutowymi Fundacji sÄ…:
Rozwój innowacjii w Polsce oraz pobudzanie zapotrzebowania na nowe technologie i innowacyjne rozwiązania,

Promowanie i propagowanie nowego zawodu Rzecznika Innowacji, którego zadaniem jest pełnienie funkcji konsultanta i integratora w procesach wdrożeń innowacyjnych technologii oraz pomoc w tworzeniu i prawidłowym funkcjonowaniu innowacyjnych przedsiębiorstw,

Rozpoznanie potrzeb innowacyjnych u potencjalnych odbiorców innowacji (małych, średnich i dużych przedsiębiorstw, samorządów, jednostek naukowych i innych beneficjentów ostatecznych) oraz stworzenie dla nich silnego wsparcia przy wdrożeniach.

Wspieranie naukowców i zespołów badawczych, pracujących w tych obszarach nauki, które posiadają znaczenie dla rozwoju cywilizacyjnego, kulturowego i gospodarczego Polski oraz jej, międzynarodowego prestiżu.

Wspomaganie inicjatyw inwestycyjnych, służących nauce i gospodarce w Polsce.

Działania na rzecz rozwoju nauki, kultury i gospodarki Rzeczpospolitej Polskiej.

Wspieranie i inicjowanie aktywności społecznej oraz pomoc w rozwoju społeczeństwa informatycznego.

Budowanie współpracy miÄ™dzynarodowej na rzecz rozwoju nauki i gospodarki. 

Organami Fundacji są Zarząd i Rada Fundacji. Zarząd Fundacji "Instytut Innowacji" reprezentuje ją na zewnątrz i kieruje jej bieżącą działalność. Rada Fundacji ustala główne kierunki działania Fundacji oraz zajmuje się kontrolą ich realizacji. Rada jest niezależna i nie podlega Zarządowi w wykonywaniu swych uprawnień. Pozostali członkowie Instytutu Innowacji to Rzecznicy Innowacji, tworzący Komisję Fundacji.